報(bào)告承辦單位:長(zhǎng)沙理工大學(xué)數(shù)學(xué)與統(tǒng)計(jì)學(xué)院
報(bào)告題目：基于深度學(xué)習(xí)的單細(xì)胞聚類(lèi)與標(biāo)注
報(bào)告內(nèi)容:本報(bào)告將匯報(bào)本課題組近期在單細(xì)胞RNA-Seq數(shù)據(jù)分析上的兩個(gè)工作ScziDesk和ScSemiCluster. 單細(xì)胞RNA-Seq技術(shù)現(xiàn)在成為了生物學(xué)研究的基本手段，但其高噪聲和稀疏性為數(shù)據(jù)分析帶來(lái)了挑戰(zhàn)。細(xì)胞聚類(lèi)和細(xì)胞標(biāo)注是單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析的最基本任務(wù)，我們?nèi)诤暇垲?lèi)和基于深度學(xué)習(xí)的非線性降維方法，開(kāi)發(fā)了聚類(lèi)方法scziDesk; 進(jìn)一步結(jié)合領(lǐng)域適應(yīng)(Domain Adaptation)方法，開(kāi)發(fā)了細(xì)胞標(biāo)注方法scSemiCluster, 模擬數(shù)據(jù)和實(shí)際數(shù)據(jù)分析表明了算法的有效性。
報(bào)告人姓名: 鄧明華
報(bào)告人所在單位:北京大學(xué)數(shù)學(xué)科學(xué)學(xué)院
報(bào)告人職稱(chēng)/職務(wù)及學(xué)術(shù)頭銜: 教授，博士生導(dǎo)師
報(bào)告時(shí)間: 2021年11月29日周一上午10:00-11:00
報(bào)告地點(diǎn): 通訊會(huì)議ID：236-235-120
報(bào)告人簡(jiǎn)介:鄧明華，男，北京大學(xué)數(shù)學(xué)科學(xué)學(xué)院教授。1987年9月-1998年1月在北京大學(xué)數(shù)學(xué)學(xué)院學(xué)習(xí)，畢業(yè)后留校工作至今。2003年8月晉升為副教授，2006年任博士生導(dǎo)師，2009年8月晉升為教授。其間2001年2月－2003年8月在美國(guó)南加州大學(xué)計(jì)算分子生物學(xué)中心從事博士后研究工作，2009年8月-2010年1月美國(guó)耶魯大學(xué)訪問(wèn)副教授。鄧明華從事生物信息學(xué)研究，發(fā)表SCI論文80余篇。曾先后主持5項(xiàng)自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目和1項(xiàng)863項(xiàng)目，參加3項(xiàng)973項(xiàng)目和1項(xiàng)科技部重點(diǎn)研發(fā)項(xiàng)目。